In Litauen gibt es etwa 2.600-2.800 Seen, die größer als 0,5 ha sind und eine Gesamtfläche
von 880 km2 haben. Seen bedecken 1,37% der Landesfläche. Die meisten Seen wurden in der Nacheiszeit gebildet, als das Schmelzwasser des Gletschers die tiefsten Senken füllte. Jedoch kleine Seen – die so genannten Sinkhöhlen oder Karsttrichter – entstehen auch heutzutage. Dies geschieht an Orten, an denen das Grundwasser Gipsschichten wegspült, was zur Bildung von unterirdischen Hohlräumen führt, die im Laufe der Zeit einstürzen. Die meisten Seen befinden sich im Hochland – Aukštaitija, Dzūkija und Žemaitija. Der tiefste See in Litauen ist der Tauragnas-See (62,5 m), der längste – der Asveja- und der Sartai-See, aber der größte – der Drūkšiai-See (4479 ha).