An einigen Stellen, an den steilen Ufern der Nemunas und seiner Nebenflüsse, gibt es geschützte Lebensräume im europäischen Maßstab – Hang- und Schluchtwälder. Sie bestehen aus Mischwäldern mit Linde, Ahorn, Eiche, Ulme, Weide und Esche. An den Nordhängen findet man Fichten. In solchen Wäldern sind die Auswirkungen menschlicher Aktivitäten eher gering, da steile Hänge und schlechte Zugänglichkeit die Holzgewinnung erschweren. Die Artenvielfalt wird durch Grundwasseraustrittsstellen und Quellbäche, Felsaufschlüsse und Gesteine in den Bachbetten kleiner Bäche, die Stromschnellen bilden, erhöht.