Neres upes sākums ir meklējams Baltkrievijā, kur upes nosaukums ir Vilija. Nere ir otra garākā Lietuvas upe. Tā plūst cauri divām lielākajām Lietuvas pilsētām – Viļņai un Kauņai un met lokus gar seno Lietuvas viduslaiku galvaspilsētu – Kernavė. Pie Kauņas tā ieplūst Nemunas upē. Abu upju satekas vieta bijusi stratēģiski nozīmīgs punkts, tādēļ šajā vietā uzbūvēta Kauņas pils un blakus atrodas Kauņas vecpilsēta. Uzskata, ka upes nosaukums ir saistāms ar lietuviešu vārdu "nerti", kas nozīmē – nirt.